柴油發電機組水箱有水垢不僅影響散熱效果還會減少機組使用壽命。水垢的形成是由于自來水中的鈣鎂離子與冷卻液中的無機鹽結合形成水垢的，而硅膠垢主要來源于無機型冷卻液中的硅酸鹽。金屬垢主要以鐵垢和焊錫垢為主。前者主要是由普通無機型冷卻液中的無機鹽與缸體上的鐵金屬反應生成的保護膜因消耗脫落形成，而后者是由具有強氧化性的無機鹽腐蝕控制劑加劇焊錫“開花”而形成的蓬松沉淀物。所以，如果冷卻系統需要加水，不能直接加自來水而是需要用冷卻液或者蒸餾水。

發電機組使用壽命跟平時的養護有直接聯系，要定期對發電機組進行清潔工作，這樣可以大限度地減少發電機組在使用中的磨損，而發電機組水箱中如果存在過多水垢，會嚴重影響柴油機的使用壽命。

清除柴油發電機組水箱內水垢的具體操作方法是：首先用30公斤水，2.5公斤苛性鈉，0.6公斤煤油配成清洗液，倒入水箱中。

然后啟動柴油機，中速運行10分鐘左右后熄火。待10至12小時后再重新啟動柴油機，中速運轉10分鐘左右熄火，放出清潔液。加入清潔的冷卻水后起動柴油機，中速運行自行清潔。如此反復2至3次，即可將水垢徹底清除干凈。